MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 plasmid p2ABTCDC0715

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017166	CAAT	2	8	232	239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017166	AAAT	2	8	907	914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017166	ACCAAT	2	12	920	931	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017166	GTC	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017166	GGC	2	6	980	985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017166	TAA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017166	TTAA	2	8	1851	1858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017166	ATT	2	6	1941	1946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017166	ATAA	2	8	1957	1964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017166	AAT	2	6	2005	2010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017166	TTA	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017166	TAA	2	6	2310	2315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017166	TAT	2	6	2326	2331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017166	TCAT	2	8	3059	3066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017166	ATG	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017166	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017166	A	6	6	3211	3216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017166	TTG	3	9	3928	3936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017166	CAA	3	9	3945	3953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017166	AAC	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017166	TTA	2	6	4040	4045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017166	TA	3	6	4061	4066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017166	T	8	8	4166	4173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017166	A	8	8	4183	4190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017166	CAA	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017166	AGG	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017166	CAA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017166	AATA	2	8	4332	4339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017166	TAA	2	6	4350	4355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017166	AT	3	6	4376	4381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017166	A	7	7	4783	4789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017166	AAT	2	6	4859	4864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017166	AT	3	6	4871	4876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017166	A	6	6	4933	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017166	GCA	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017166	T	6	6	4958	4963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017166	ATA	2	6	4970	4975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017166	TGA	2	6	10955	10960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017166	A	6	6	10971	10976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017166	T	6	6	14012	14017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017166	T	6	6	15181	15186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017166	CGC	2	6	15225	15230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017166	ATA	2	6	15245	15250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017166	GGA	2	6	15337	15342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017166	AAG	2	6	15365	15370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017166	ATA	2	6	15371	15376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017166	ATCT	2	8	15418	15425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017166	ATA	2	6	21628	21633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017166	TC	3	6	21703	21708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017166	A	6	6	24667	24672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017166	AGG	2	6	24674	24679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017166	GCT	2	6	24693	24698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017166	AGAA	2	8	26113	26120	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017166	AG	3	6	26166	26171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017166	A	6	6	26295	26300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017166	TTA	2	6	26301	26306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017166	TAAC	2	8	26307	26314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017166	CAAT	2	8	26317	26324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017166	T	7	7	26348	26354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017166	ATT	2	6	26385	26390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017166	A	7	7	27842	27848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017166	AAAT	2	8	27903	27910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017166	T	6	6	27916	27921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017166	GTAC	2	8	27927	27934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017166	AT	3	6	27936	27941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017166	ATC	2	6	27952	27957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017166	TACA	2	8	27968	27975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017166	TAA	2	6	29058	29063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017166	TAA	2	6	29080	29085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017166	T	6	6	29098	29103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017166	GCT	2	6	29146	29151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017166	ATT	2	6	29225	29230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017166	ACA	2	6	29537	29542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017166	T	6	6	29846	29851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017166	A	9	9	29891	29899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017166	ATTT	2	8	29934	29941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017166	A	6	6	30014	30019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017166	TGA	2	6	30084	30089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017166	T	8	8	30090	30097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017166	ATGCT	2	10	30108	30117	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017166	TC	3	6	30153	30158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017166	GTT	2	6	30161	30166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017166	AAC	2	6	30193	30198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017166	TAA	2	6	30276	30281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017166	GT	3	6	30291	30296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017166	GCA	2	6	31487	31492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017166	TGAT	2	8	31496	31503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017166	T	8	8	31503	31510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017166	AGTAT	2	10	31511	31520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017166	ATG	2	6	34154	34159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017166	A	6	6	34182	34187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017166	TGA	2	6	34221	34226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017166	TAAA	2	8	34232	34239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017166	T	8	8	34636	34643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017166	TTAGA	2	10	34665	34674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017166	T	8	8	35091	35098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017166	ATA	2	6	35135	35140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017166	GTTT	2	8	35145	35152	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017166	TAG	2	6	35164	35169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017166	AT	3	6	35592	35597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017166	A	6	6	35629	35634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017166	T	6	6	35643	35648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017166	CTA	2	6	35692	35697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017166	ACAA	2	8	35724	35731	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017166	TTGAA	2	10	35735	35744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017166	A	7	7	36566	36572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017166	TTA	2	6	37471	37476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017166	AT	3	6	37483	37488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017166	T	6	6	37839	37844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017166	CAA	2	6	37900	37905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017166	AAT	2	6	37909	37914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017166	AGG	2	6	38469	38474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017166	TAAA	2	8	38478	38485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017166	AAG	2	6	39441	39446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017166	TCC	2	6	40645	40650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017166	TAT	2	6	40662	40667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017166	ATTT	2	8	40673	40680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017166	TA	3	6	40685	40690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017166	A	6	6	40692	40697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017166	TTA	2	6	40854	40859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017166	CTT	2	6	40889	40894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017166	GTC	2	6	40897	40902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017166	TGAC	2	8	40922	40929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017166	TCA	2	6	40978	40983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017166	ATT	2	6	41019	41024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017166	A	7	7	41026	41032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017166	ATTAA	2	10	41040	41049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017166	TTA	2	6	41053	41058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017166	GTA	2	6	41099	41104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017166	TTAG	2	8	41110	41117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017166	A	6	6	41690	41695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017166	T	7	7	42473	42479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017166	GTT	2	6	42511	42516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017166	CAA	2	6	42526	42531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017166	TAG	2	6	42591	42596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017166	AAC	2	6	44698	44703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017166	G	6	6	44710	44715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017166	CCT	2	6	44719	44724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017166	TTTA	2	8	44727	44734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017166	AGT	2	6	46110	46115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017166	ATTA	2	8	46671	46678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017166	TAAA	2	8	49115	49122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017166	AT	3	6	49142	49147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017166	TAT	2	6	49150	49155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017166	TGA	2	6	49179	49184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017166	ATT	2	6	50848	50853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017166	T	6	6	51994	51999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017166	T	6	6	52373	52378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017166	GAG	2	6	52397	52402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017166	TAA	2	6	53149	53154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017166	GTTC	2	8	53176	53183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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188	NC_017166	T	6	6	59592	59597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017166	TAA	2	6	59600	59605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.